Siendo una gran figura pública, Juan Gabriel fue expuesto a algunos casos, en los que estuvo envuelto en la polémica.
“Juan Ga” tuvo varios problemas en su carrera, como con su disquera, por lo que estuvo ausente del ámbito musical.
También tuvo un gran problema, con quien fuera su compañera en muchos duetos, conciertos y colaboraciones: Rocío Dúrcal, terminando su relación laboral. La cantante nunca dijo porqué se pelearon, pero varias versiones, señalan que Antonio Morales Barreto Junior, quien fuera esposo de Dúrcal, tuvo una relación con Juan Gabriel, y esto sería el motivo de separación.
Durante su carrera, el “Divo de Juárez” se vio envuelto en problemas con Hacienda, siendo detenido en múltiples ocasiones, pero liberado tras poder pagar fianza y arreglar el problema. En marzo de 2012, una casa en de Juan Gabriel, en Torreón, fue embargada por un adeudo de predial.
En 2011, un hombre de 41 años lo acusó por abuso sexual, pero el cantautor aseguró que era una mentira.
Y cómo olvidar la memorable caída en 2005 en un concierto en Houston, Texas. El cantante bailaba sobre el escenario, se trabó y cayó, lastimándose las muñecas.
Durante este año, Anathan Briss, declaró que cuando era joven, cuando tenía 18 años, Juan Gabriel llegó a ejercer la prostitución en la Ciudad de México, pero él no declaró ante el caso.